Тема информационной безопасности не теряет своей актуальности на протяжении многих лет, и Координационный центр уделяет этой теме особое внимание – в первую очередь, в области безопасности доменного пространства. Для этого Координационный центр внедрил практику взаимодействия с организациями, компетентными в определении нарушений в сети Интернет, а также создал проект "Нетоскоп", в рамках которого крупнейшие российские компании организовали научно-техническое сотрудничество для совместного развития исследовательской платформы по агрегации информации о вредоносных ресурсах в сети Интернет, проведения анализа источников «зловредов» и обмена аналитическими данными. Для формирования безопасного интернет-пространства для детей и подростков при непосредственном участии КЦ создан и успешно развивается кириллический домен верхнего уровня .ДЕТИ, который предназначен для размещения в нем интернет-ресурсов исключительно детской тематики.
